المنتديات العلمية

منتدى علم الاحياء => منتدى الاحياء العام => الموضوع حرر بواسطة: bioComputer في أكتوبر 08, 2005, 08:24:57 مساءاً

العنوان: نقاش اليوم الثالث لدورة البيوانفورماتك
أرسل بواسطة: bioComputer في أكتوبر 08, 2005, 08:24:57 مساءاً
السلام عليكم ورحمة الله وبركاته ...  
مرحباً بكم فى اليوم الثانى من  دورة مبادئ علم المعلومات الحيوية .... Bioinformatics ..

أذكركم بمراجعة درس اليوم الثالث للاهمية ..( بدأنا الجد :) )



وصلة للدرس الثالث


اللقاء الثالث في ملف pdf


:)
العنوان: نقاش اليوم الثالث لدورة البيوانفورماتك
أرسل بواسطة: bioComputer في أكتوبر 08, 2005, 08:33:45 مساءاً
اعتذر عن حورى للنقاش اليوم فى الموعد المحدد ... لوجود ظرف طارئ ... وهو وفاة والد احد جيرانى .. نسأل الله عزوجل ام يغفر له ويرحمه ويسكنه فسيح جنته فى تلك الايام الطاهرة المباركة ..

فارجو ان تتقبلوا اعتذاى .. وسأحاول بقد الامكان الحو حتى ولو فى وقت متاخر ...
لكن المهم ان تستثمروا وقتكم انتم فى النقاش معا وطرخ الاسئلة والاجابة عليها ...
العنوان: نقاش اليوم الثالث لدورة البيوانفورماتك
أرسل بواسطة: bioComputer في أكتوبر 08, 2005, 08:44:55 مساءاً
اسئلة للنقاش



1- ما المقصود بــ ( نسخة (Clone ) ) ؟

2- ما الفرق بين الجين والجينوم ؟؟

3- ما هو وظيفة البلازمبد ؟؟

4- ما الفرق بين البروتين والانزيم ؟

5- ما وظيفة جهاز Bacterial Restriction/Modification ؟؟

:)
العنوان: نقاش اليوم الثالث لدورة البيوانفورماتك
أرسل بواسطة: bioComputer في أكتوبر 08, 2005, 08:51:26 مساءاً
اسئلة للنقاش



6- ما عدد الاجزاء الناتجة عند قطع بلازميد دائرى ثلاث مرات ؟؟


7-
العنوان: نقاش اليوم الثالث لدورة البيوانفورماتك
أرسل بواسطة: Dawn Breeze في أكتوبر 08, 2005, 08:51:56 مساءاً
وعليكم السلام ورحمة الله وبركاته

لاحول ولا قوة إلا بالله، رحمه الله وأسكنه فسيح جناته، وأنعم على أهله بالصبر..


ولنا عودة لنقاش اليوم إن شاء الله
العنوان: نقاش اليوم الثالث لدورة البيوانفورماتك
أرسل بواسطة: bioComputer في أكتوبر 08, 2005, 08:53:39 مساءاً
فلاش عن نسخ الجينات .. مهم جدا :
http://www.bic.org.my/subpage/issue/genecloning.swf

الاستنساخ :

http://www.reproductivecloning.net/hosting/waite/cloning.swf
العنوان: نقاش اليوم الثالث لدورة البيوانفورماتك
أرسل بواسطة: دمية الثلج في أكتوبر 08, 2005, 10:49:08 مساءاً
1- ما المقصود بــ ( نسخة (Clone ) ) ؟
كلمة نسخة (Clone ) هي مجموعة من الخلايا أو المخلوقات الحية المتطابقة جنياً (أي أن مادتها الوراثية متطابقة) نتجت من خلية واحدة أو مخلوق واحد عن طريق التكاثر اللاجنسي. ومن هذا يمكن تعريف الإستنساخ بأنه عملية إنتاج نسخ مطابقة وراثياً للخلية أو المخلوق الأصلي.

2- ما الفرق بين الجين والجينوم ؟؟
الجين هو :قطع من الدنا ( الدي إن أي DNA ) (مورث)
الجينوم : أو جميع الجينوم(أي كل الدي إن أي الموجود في الكائن الحي).

3- ما هو وظيفة البلازمبد ؟؟
البلازميد (  Plasmid )

 و هي من اشهر الناقلات ،و هو عبارة عن قطعة صغيرة من الحمض النووي قابلة للتكاثر بمعزل عن بقية الحمض النووي الموجود في الكروموسومات .و هي شبيهة بالفيروس الصغير و لكنها لا تحتوي على طبقة خارجية من البروتين.
 و البلازميد عبارة عن قطعة من الحمض النووي موجود في البكتيريا خاصة في  الاي كولي(E.Coli) و بعض أنوع الخميرة ( Yeast) .و لدية القدرة على التكاثر الذاتي و بمعزل من بقية الكروموسومات
الموجودة في الخلية.كما أن هناك بلازميدات تستطيع التكاثر داخل البكتيريا و الخميرة في آن واحد. و يوجد نوعان من البلازميد على حسب نوع الحمض النووي فيها فهناك البلازميد المصنوع من الدي إن أي (DNA ) و نوع أخر مصنوع من الأر إن أي (RNA ). و هناك أنواع عديدة من البلازميد فمنها الصغير و منها الكبير كما أن منها ما لا يحتوي على أي جين بينما هناك أنواع كبيرة تحتوي على عدة جينات.و بالإضافة إلى وحدة التكاثر الذاتي الموجد على البلازميد هناك الكثير من الجينات التي قد تكون على البلازميد و هي مفيدة للعلماء في عملية نسخ الجينات و القطع النووية

4- ما الفرق بين البروتين والانزيم ؟
الانزيمات :

الانزيمات ما هى فى الاصل الا بروتينات تعمل كحفاز او كعامل مساعد فى التفاعلات الحيوية تزيد من سرعة التفاعلات ولكن لا تغير من طبيعتها .
البروتين له أهمية عظيمة من حيث القيمة الحيوية لاحتوائه على الأحماض الأمينية الحيوية المفيدة للنمو والصحة وهي أنسب المواد الغذائية لبناء الأنسجة

5- ما وظيفة جهاز Bacterial Restriction/Modification ؟؟
هو الجهاز المناعي لدي البكتريا إذ من خلاله تعمل البكتريا على تكسير الجين  الغريب و الحمض النووى الغريب الخاص بالفيروسات فيعرف بنظام التحديد او القطع المحدد والتعديل او التحوير Bacterial Restriction/Modification system.

6- ما عدد الاجزاء الناتجة عند قطع بلازميد دائرى ثلاث مرات ؟؟
العدد اذا كان الشريط دائرى فإن عدد القطع يساوى نفس العدد الناتج من القانون
اي بالنسبة لسؤال فالعدد هو = 3
العنوان: نقاش اليوم الثالث لدورة البيوانفورماتك
أرسل بواسطة: bioComputer في أكتوبر 09, 2005, 12:13:12 صباحاً
ما شاء الله عليك اختى دمية الثلج .. نشاط رائع .. لكن الاجابات احس انها قص ولصق :rock:
بس الصراحة اعجبتنى اجابة البلازميد .. ممتازة ( كأنك قرأت الدرس القادم :D  )

باين عليك تخصصك قريب من البيولوجى .. هل هذا صحيح ;)
العنوان: نقاش اليوم الثالث لدورة البيوانفورماتك
أرسل بواسطة: دمية الثلج في أكتوبر 09, 2005, 12:22:20 صباحاً
مشكوور

وبالنسبة للقص و اللزج فعلاً لاني ابحث عن المعلومات واتقصى

اما التخصص فأنا بكالوريوس أحياء عامة  

والحماس اللي انا فيه منبعه حماس المجموعة و حرصهم على توثيق و توسيع المعلومات

فعلا انا استفدت هنا فائدة كبيرة جدا بارك الله فيكم

واتنظر تمام المناقشة



العنوان: نقاش اليوم الثالث لدورة البيوانفورماتك
أرسل بواسطة: bioComputer في أكتوبر 09, 2005, 12:27:49 صباحاً
اقتباس

وبالنسبة للقص و اللزج فعلاً لاني ابحث عن المعلومات واتقصى

انا اقصد ولصق من الدرس مباشرة دون الكتابة من الرأس ..:)

اقتباس

اما التخصص فأنا بكالوريوس أحياء عامة في اخر سنة ان شاء الله



ربنا يوفقك ان شاء الله .. وترفعى راسنا لفوق قووووووووووووووووووووى ..
عايزينك تطلعى الاولى او باذن الاولى الله :)

اقتباس

والحماس اللي انا فيه منبعه حماس المجموعة و حرصهم على توثيق و توسيع المعلومات

فعلا انا استفدت هنا فائدة كبيرة جدا بارك الله فيكم


الحمدلله الذى وفقنا جمعياً معا ... والخقيقة انا الذى استفدت كثيرا والحمدلله :)
العنوان: نقاش اليوم الثالث لدورة البيوانفورماتك
أرسل بواسطة: ابو يوسف في أكتوبر 09, 2005, 12:28:29 صباحاً
اقتباس (bioComputer @ 08/10/2005 الساعة 19:33)
اعتذر عن حورى للنقاش اليوم فى الموعد المحدد ... لوجود ظرف طارئ ... وهو وفاة والد احد جيرانى .. نسأل الله عزوجل ام يغفر له ويرحمه ويسكنه فسيح جنته فى تلك الايام الطاهرة المباركة ..

فارجو ان تتقبلوا اعتذاى .. وسأحاول بقد الامكان الحو حتى ولو فى وقت متاخر ...
لكن المهم ان تستثمروا وقتكم انتم فى النقاش معا وطرخ الاسئلة والاجابة عليها ...

السلام عليكم

رحمه الله واسكنه فسيح جناته

إنا لله وإنا إليه لراجعون
العنوان: نقاش اليوم الثالث لدورة البيوانفورماتك
أرسل بواسطة: ابو يوسف في أكتوبر 09, 2005, 12:31:30 صباحاً
ذكرت اخي العزيز ان هنالك حاجة للكثير من النسخ لوجود تعقيدات انشائية للكروموسونات

هل يمكنك توضيح تلك التعقيدات؟

هل هي ناتجة عن الحجم فقط؟

وجزاك الله كل خير



العنوان: نقاش اليوم الثالث لدورة البيوانفورماتك
أرسل بواسطة: bioComputer في أكتوبر 09, 2005, 12:31:51 صباحاً
اسئلة متميزة



- كيف نستطيع الحصول على الدنا dna دون الرنا rna من الخلية ??

- كيف نستطيع ان نطيل شريط الدنا ؟؟

- كيف نعكس عملية نسخ شريط الرنا من الدنا ( اى ننسخ الدنا من الرنا ) ؟؟
العنوان: نقاش اليوم الثالث لدورة البيوانفورماتك
أرسل بواسطة: Dawn Breeze في أكتوبر 09, 2005, 12:34:43 صباحاً
السلام عليكم ورحمة الله وبركاته

ما شاء الله عليك أختي دمية والله يوفقك :)..

أستاذنا bioComputer، ما شاء الله درسنا اليوم كان ممتع، وأسلوب طرحه بسيط وواضح:)


طيب محاولتي لحل أسئلة النقاش:

اقتباس
1- ما المقصود بــ ( نسخة (Clone ) ) ؟

هي المجموعة من الخلايا الحية المتطابقة جينيا، والتي نتجت عن تكاثر لاجنسي

اقتباس
2- ما الفرق بين الجين والجينوم ؟؟

بصراحة لم أفهم الفرق بينهما  :rock: ..

اقتباس
3- ما هو وظيفة البلازمبد ؟؟

يقوم البلازميد بحمل الجين المراد نسخه إلى الخلية البكتيرية، وكل ما يحدث انقسام للخلية البكتيرية ينقسم البلازميد مع الجين

اقتباس
4- ما الفرق بين البروتين والانزيم ؟

الانزيمات هي بروتينات ولها تعمل كمحفزات  أو عوامل مساعدة للتسريع في عمليات التفاعل الحيوية

اقتباس
5- ما وظيفة جهاز Bacterial Restriction/Modification ؟؟

جهاز مناعى  يوجد في الخلايا البكتيرية يساعدها على القضاء على أي حمض نووي دخيل على الخلية البكتيرية

اقتباس
6- ما عدد الاجزاء الناتجة عند قطع بلازميد دائرى ثلاث مرات ؟؟

3 قطع



وجزاكم الله خيرا



العنوان: نقاش اليوم الثالث لدورة البيوانفورماتك
أرسل بواسطة: bioComputer في أكتوبر 09, 2005, 12:40:18 صباحاً
جزاك الله كل خير اخى ابو يوسف ..
اقتباس

ذكرت اخي العزيز ان هنالك حاجة للكثير من النسخ لوجود تعقيدات انشائية للكروموسونات
هل يمكنك توضيح تلك التعقيدات؟


ما شاء الله عليك ما تفوت اى حاجة ابدا ..:rock:
للاسف الكرموسومات هى مووع خارج نطلق الدورة... وقد احترت كثيرا عندوع الدورة هل اتحدث عليها ام لا ..
وفلت عدم الحديث حتى لا اشتت الحاضرين .. وفى نفس الوقت تكون حمل معلومات زائد دون الحاجة الكثيرة اليه ..

فشرائط الدنا هى التى تكون الكرموسومات .. ولكن شرائط الدنا تكون ملتفة بطريقة معقدة حول بروتين معين ليكون فى النهاية الكرموسوم ... فهى تكون معقدة جدا فى التفافها .. اتمنى ان تكون وصلت المعلومة ...

وسؤلك هذا سأعتبره واحد من الاسئلة المطلوب من بقية الاخوة مناقشتها هنا ان شاء الله ...:)
العنوان: نقاش اليوم الثالث لدورة البيوانفورماتك
أرسل بواسطة: Dawn Breeze في أكتوبر 09, 2005, 12:40:35 صباحاً
[quote- كيف نستطيع الحصول على الدنا dna دون الرنا rna من الخلية ??[/quote]

عن طريق استخدام انزيم الدى اى ان بوليمريز  1DNA polymerase
يقوم بعمل نسخ من الحمض النووى عن طريق لصق النيوكلوتيدات ببعهضا البعض .



اقتباس
- كيف نعكس عملية نسخ شريط الرنا من الدنا ( اى ننسخ الدنا من الرنا ) ؟؟

عن طريق استخدام انزيم النسخ العكسى Reverse transcriptase



العنوان: نقاش اليوم الثالث لدورة البيوانفورماتك
أرسل بواسطة: bioComputer في أكتوبر 09, 2005, 12:44:24 صباحاً
اختى Dawn Breeze  اهلا بك ..
درس بسيط ولكنه مهم .. ويقوم عليه بقية الدروس القادمة ..
ما شاء اجابتك ممتازة .. ومختصرة :)


اقتباس

اقتباس  
2- ما الفرق بين الجين والجينوم ؟؟

بصراحة لم أفهم الفرق بينهما  :rock: ..

الفرق بسيط ... الحين هو قطعة من الجينوم ..:laugh:
مثل عود الكبريت قطعة من علبة الكبريت .. تمام كده :D
العنوان: نقاش اليوم الثالث لدورة البيوانفورماتك
أرسل بواسطة: bioComputer في أكتوبر 09, 2005, 12:47:08 صباحاً
اجابة موفقة اخت Dawn Breeze  نعم هو انزيم Reverse transcriptase :)
العنوان: نقاش اليوم الثالث لدورة البيوانفورماتك
أرسل بواسطة: bioComputer في أكتوبر 09, 2005, 12:49:33 صباحاً
اقتباس

[quote- كيف نستطيع الحصول على الدنا dna دون الرنا rna من الخلية ??


عن طريق استخدام انزيم الدى اى ان بوليمريز  1DNA polymerase
يقوم بعمل نسخ من الحمض النووى عن طريق لصق النيوكلوتيدات ببعهضا البعض .
[/QUOTE]

لا ... اجابة تعتبر صحيحة .. ولكن ليست ما اردته ..
انا لا ايد نسخة من الدنا ... بل ايد عزل الدنا من الخلية دون الرنا .. حاولى البحث فليلاً .. ستجدى الحل :)
العنوان: نقاش اليوم الثالث لدورة البيوانفورماتك
أرسل بواسطة: Dawn Breeze في أكتوبر 09, 2005, 12:58:48 صباحاً
اقتباس
كيف نستطيع الحصول على الدنا dna دون الرنا rna من الخلية ??


هل يكون باستخدام انزيمات التعديل والتحوير، هذا إذا كان الكلام عن عزل الحمض النووي الدخيل على الخلية البكتيرية؟؟:rock:
العنوان: نقاش اليوم الثالث لدورة البيوانفورماتك
أرسل بواسطة: bioComputer في أكتوبر 09, 2005, 01:01:45 صباحاً
لالا .. خاولى مرة اخرى ...:0
العنوان: نقاش اليوم الثالث لدورة البيوانفورماتك
أرسل بواسطة: bioComputer في أكتوبر 09, 2005, 01:04:29 صباحاً
حسنا .. تعديل فى صيغة السؤال ليناسب الدرس :

كيف نستطيع الحصول على  الرنا rna  دون الدنا dna من الخلية ??
العنوان: نقاش اليوم الثالث لدورة البيوانفورماتك
أرسل بواسطة: Dawn Breeze في أكتوبر 09, 2005, 01:10:07 صباحاً
إذاً هل سنلجأ إلى انزيم دى انيز1  DNaseI، الذى يقطع شريط الدى ان ايه سواء كان شريط واحد ام شريطين فى مواقع مختلفة ، ويستخدم فى تنقية الار ان ايه من الدىان ايه فى عملية العزل واستخلاص الاران ايه من الخلية؟
العنوان: نقاش اليوم الثالث لدورة البيوانفورماتك
أرسل بواسطة: bioComputer في أكتوبر 09, 2005, 01:12:57 صباحاً
تمام ماشاء الله عليك :)

وايا نستخدم الانزيم اران نبز RNAase  الاجابة على سؤالى الذى طرحته فى الاول
اقتباس

كيف نستطيع الحصول على الدنا dna دون الرنا rna من الخلية ??


ويبدو اننى نسيته كتابته فى الدرس ... جل من لا يسهو :blush:
العنوان: نقاش اليوم الثالث لدورة البيوانفورماتك
أرسل بواسطة: bioComputer في أكتوبر 09, 2005, 01:14:55 صباحاً
ملحوظة ..
نحن نستخدم المقطع ايز ( ase ) للدلالة على ان هذا انزيم ...
مثل الدنا وانزبم الدنا ابز DNA ___> DNase
العنوان: نقاش اليوم الثالث لدورة البيوانفورماتك
أرسل بواسطة: أبو فيصل في أكتوبر 09, 2005, 01:16:30 صباحاً
ما شاالله تبارك الله ,,, حقاً ما أجملكم  :)


 كيف نستطيع الحصول على  الرنا rna  دون الدنا dna من الخلية ؟؟ أو العكس ؟

 
 بإختصار شديد / عن طريق جهاز الفصل الكهربي ,, Electrophorsis


 والبلازميد أيضاً يعزل من الخلية بهذه الطريقة ,, والبروتينات كذلك  :)


 وممكن نسحب محتويات الخلية من السيتوبلازم فقط ,, ثم عمل تدريجات في الطرد المركزي لنحصل على الرنا ,, لأنه سيكون موجوداً في الستوبلازم أما الدنا فلا لأنه بقدس الأقداس "النواة" .



 تحياتي للجميع .
العنوان: نقاش اليوم الثالث لدورة البيوانفورماتك
أرسل بواسطة: bioComputer في أكتوبر 09, 2005, 01:25:14 صباحاً
تمام استاذى ابوفيصل .... ولكنها من خارج نطاق الدرس .......هههههههههههههههه

امزح ...

:)
العنوان: نقاش اليوم الثالث لدورة البيوانفورماتك
أرسل بواسطة: Dawn Breeze في أكتوبر 09, 2005, 01:25:37 صباحاً
اقتباس
كيف نستطيع ان نطيل شريط الدنا ؟؟


؟؟؟
العنوان: نقاش اليوم الثالث لدورة البيوانفورماتك
أرسل بواسطة: bioComputer في أكتوبر 09, 2005, 01:28:39 صباحاً
سؤال متميز ...


كيف نضيف مواد مشعة الى شريط الدنا ؟؟؟
العنوان: نقاش اليوم الثالث لدورة البيوانفورماتك
أرسل بواسطة: دمية الثلج في أكتوبر 09, 2005, 01:30:05 صباحاً
كيف نستطيع الحصول على الدنا dna دون الرنا rna من الخلية ??
يتم ذلك كما يأتي
-قص و قطع الحمض النووي(Cleavage of DNA ) بمقصاة خاصة تسمى (Restriction Nucleases )و اكتشاف هذه المقصاة ساعد كثيرا في مهمة التحكم في الدي إن أي.

 2- فصل قطع الدي إن أي على لوح من الجل بالكهرباء (Gel Electrophoresis ).

 3-معرفة التسلسل النووي(DNA sequencing ) لكل قطع الدي إن أي التي يتم عزلها بشكل سريع و دقيق.و التي تسمح للعلماء معرفة التركيب الإنشائي للجينات و معرفة و استنتاج نوع البروتين الذي ينتج منه.

 4- تقنية تهجين الحمض النووي(Nucleic acid hybridization )، و التي مكنتنا في معرفة أحجام القطع من الحمض النووي و الكشف عن القطع المحددة من الحمض النووي في خليط معقد من القطع المتشابهة.

 5-استنساخ الدي إن أي(DNA cloning )، و التي تسمح بإنشاء نسخ عديدة و متطابقة من القطع الدي إن أي.

 6-تقنية هندسة أو تعديل الدي إن أي (DNA engineering )، و التي تسمح بإنتاج نسخة معدلة من جين ما ثم أعادته مرة أخرى إلى الخلية.


- كيف نستطيع ان نطيل شريط الدنا ؟؟
 
 
 
 
 
 
صفحة الهندسة الوراثية الرئيسية



معرفة التسلسل النووي(DNA sequencing )

 لا شك أن العلماء يحتاجون إلى معرفة التركيبة التسلسلية لكل جين و هذا يمكنهم من معرفة المزيد عن البروتين الذي يصنعه ذلك الجين وعن التركيبة التنظيمية لعمل الجين و قد يصلون على ضوءه إلى معرفة الأمور التي تتحكم في عمله.كما انه بمعرفة التسلسل النووي للجين يمكن مقارنته بالجينات التي سبق اكتشافها و هذا قد يعطي معلومات غزيرة عن وضيفة هذا الجين و يختصر الكثير من الابحاث

و يتجنب اعادة اجرائها.وهناك طريقتان أساسيتان لمعرفة التسلسل النووي لأي قطعة من الدي إن أي.الأولى تسمى بالطريقة الإنزيمية (Enzymatic method ) و الأخرى بالطريقة الكيميائية(Chemical ).و لقد طغت الطريقة الأولى حتى أصبحت هي الطريقة الأكثر استعمالا.

الطريقة الإنزيمية (Enzymatic method ):
 يطلق على هذه الطريقة أيضا طريقة سنجر (Sanger procedure )نسبة إلى د.فريدريك سنجر و الذي أسس هذه الطريقة.كما أنها أيضا تعرف التسلسل عن طريق دي ديوكسي (dideoxy sequencing).و تترتكز هذه الطريقة على مفهوم أن شريط الدي إن أي في الأساس مبنى من جزيئات من الديوكس
 

نيوكلويتيد (deoxynucleotides (dNTPs )و يوجد على النقطة الثالثة من حلقة السكر الريبوزي مجموعة مؤكسدة أي مجموعة هيدروكسيه( OH)و هذه النقطة هي التي ترتبط في النقطة الخامسة من الجزيء الذي يليها  و هكذا يتم الترابط لتكوّن شريط طويل من الدي إن أي.و لقد قام د.ستنجر بالاستفادة من هذه الخاصية فبدّل الجزيء من (OH)إلى (H ) عن طريق إضافة دي ديوكسيو بيوكلوتيد(ddNTPs) بدل من ديوكسي نيوكلوتيد(dNTPs ) و ذلك عن طريق نسخ الشريط مرة أخرى و هذا يؤدي الى توقف ترابط الجزيئات و يكون في طرف كل جزيء نوع واحد من الأحماض النووية.



هنا اكتفي لعلي لا أكثر عليكم
العنوان: نقاش اليوم الثالث لدورة البيوانفورماتك
أرسل بواسطة: Dawn Breeze في أكتوبر 09, 2005, 01:36:11 صباحاً
هه!!
مواد مشعة؟!

طيب انا عندي سؤال: لما ندخل مواد مشعة للدنا، ما هي النتيجة التي سنصل إليها؟؟
حيوان مشع مثلا؟؟!!:laugh:

ساعدوني!! بدأت أفقد السيطرة!!
:(
العنوان: نقاش اليوم الثالث لدورة البيوانفورماتك
أرسل بواسطة: bioComputer في أكتوبر 09, 2005, 01:36:53 صباحاً
حاولى البحث وستجدى الاجابة واحة ..
العنوان: نقاش اليوم الثالث لدورة البيوانفورماتك
أرسل بواسطة: bioComputer في أكتوبر 09, 2005, 01:39:06 صباحاً
هههههههههه ...

نحن نستخدم مواد مشعة فى الدنا لنعرف هو وصل الى فين ( وكذلك عن طريق تعليمه بنيكلوتيدات مشعة .. يتم الكشف عنها بجهاز الاشعاع ) ... وهل نجحت عملية الكلونة ام لا  ...:laugh:
العنوان: نقاش اليوم الثالث لدورة البيوانفورماتك
أرسل بواسطة: bioComputer في أكتوبر 09, 2005, 01:43:50 صباحاً
اختى دمية الثلج .. شكا لك على النقل ...
على فكرة صفحة الهندسة الواثية من مصاد المهمة المكتوبة فى نهاية الدوة ... ولكن ليس كل بها سيتم شحه فى لدورة ..
فقد حاولت بقدر الاماكن اضافة الجديد الى صفحات النت .. حتى لايصبح الكلام واحد فى كل مواقع الويب ...

اللهم الا الاساسيات التى لابد من ذكرها ... قمت بنقلها وتبسيطها قدر الاماكن ..

وشكرا لك :)
العنوان: نقاش اليوم الثالث لدورة البيوانفورماتك
أرسل بواسطة: Dawn Breeze في أكتوبر 09, 2005, 01:46:15 صباحاً
خير إن شاء الله :D

الآن وضحت الرؤية :cool: ..


معليش بس يمكن لأن الوقت تأخر،
أستأذنكم الآن.. ونلتقي في الغد بإذن الله تعالى

وجزاكم الله كل الخير وبارك فيكم

:)
العنوان: نقاش اليوم الثالث لدورة البيوانفورماتك
أرسل بواسطة: bioComputer في أكتوبر 09, 2005, 01:51:10 صباحاً
حسنا ،، نراك على خي غدا باذن الله :)
العنوان: نقاش اليوم الثالث لدورة البيوانفورماتك
أرسل بواسطة: دمية الثلج في أكتوبر 09, 2005, 02:32:26 صباحاً
مشكور على التوضيح و النقل والتبسيط بس بالفعل الدرس صعب شوي

وانا احاول توضيحه لنفسي و لا انساكم معي

الله يعطيك الف عافية على الجهد الذي تبذله لنا

لانه هنا الكثير من المعلومات اللي كنت افتقد لها وجدتها هنا ومن خلال البحث في مناجم النت الغنية بهذا التوضيح

الف شكر للقائمين على هذا الصرح الرائع
العنوان: نقاش اليوم الثالث لدورة البيوانفورماتك
أرسل بواسطة: دانة العراقية في أكتوبر 09, 2005, 12:39:23 مساءاً
:203:

             دانه
          قسم علوم الممات الدايولوجي:(
العنوان: نقاش اليوم الثالث لدورة البيوانفورماتك
أرسل بواسطة: المتعلمة في أكتوبر 09, 2005, 04:25:43 مساءاً
السلام عليكم ورحمة الله وبركاته

النسخة clone: هي مجموعة من الخلايا الناتجة من خلية واحدة بالتكاثر اللاجنسي.
الجين: قطعة صغيرة من الكروموسوم.          الجينوم: كل ال DNA الموجود في جسم الكائن الحي.
البلازميدات: عبارة عن أجزاء من DNA توجد خارج الكروموسوم البكتيري. وتوجد أنواع منها حاملة للمعلومات الوراثية التي تحدد مقاومة أو حساسية البكتيريا للمضادات الحيوية وكذلك القدرة على تكوين الاورام النباتية.
البروتين: مادة مصنوعة من الاحماض الامينية.              الانزيم: نوع من البروتين يسرع التفاعلات الكيميائية في الخلية.
أجبت عن بعض الاسئلة  لكني أريد طرح البعض منها.............. :203:

أولا: القاعدة P=1\4N  ما دخلت مخي وضحوها شوي؟؟؟؟؟؟؟؟؟؟؟

ثانيا: عبارة"الجين عبارة عن قطع صغيرة من الكروموسوم أو الجينات فكيف يمكن الحصول على الجين منها؟ " أيقصد الحصول على الجين من الكروموسوم أو الجينات أم ماذا؟؟؟؟؟؟؟؟؟

ثالثا: ماهي التعقيدات الانشائية للكروموسومات التي تجعل العلماء يقومون بنسخ القطع الجينية؟؟؟؟؟
 :200:
أرجو أن لاأكون قد أطلت عليكم...............
العنوان: نقاش اليوم الثالث لدورة البيوانفورماتك
أرسل بواسطة: ابو يوسف في أكتوبر 09, 2005, 04:36:42 مساءاً
السلام عليكم

اختي الكريمة المتعلمة

اقتباس
ثالثا: ماهي التعقيدات الانشائية للكروموسومات التي تجعل العلماء يقومون بنسخ القطع الجينية؟؟؟؟؟


لقد تم طرح السؤال اعلاه سابقا

وقد اقترح الاخ الكريم بيوكمبيوتر ان يناقش وبتوسع

:)
العنوان: نقاش اليوم الثالث لدورة البيوانفورماتك
أرسل بواسطة: bioComputer في أكتوبر 09, 2005, 06:44:09 مساءاً
الاخت دانة .. اين اجابتك ؟؟؟
العنوان: نقاش اليوم الثالث لدورة البيوانفورماتك
أرسل بواسطة: أبو سلطان في أكتوبر 09, 2005, 07:02:08 مساءاً
السلام عليكم ورحمة الله : تحية طيبة

شكرا أخي العزيز biocomputer على هذا الطرح الرائع ...وشكرا للأخوات والأخوة

الأكارم على النقاش التفاعلي المتميز .


اقتباس
كيف نضيف مواد مشعة الى شريط الدنا ؟؟؟


تستخدم ثلاث طرق لجعل الأحماض النووية مشعة :

1 ـ استخدام C14 .لتمييز احدى ذرات الكربون في السكر الخماسي.
                  الكربون الطبيعي C12

2 ـ استخدام P37 . لتمييز مجوعة الفوسفات .
                   الفوسفات الطبيعي P35

3ـ استخدام التريتوم H3 . لتمييز إحدى ذرات الهيدروجين
                        الهيدروجين الطبيعي H2

ويستخدم لتتبع مكان وصول المواد المشعة جهاز scenitilation  counter


تحياتي ....
العنوان: نقاش اليوم الثالث لدورة البيوانفورماتك
أرسل بواسطة: bioComputer في أكتوبر 09, 2005, 07:06:44 مساءاً
الاخت المتعلمة .. مرحبا بك ..

اقتباس

القاعدة P=1\4N  


اختى عندما نريد ان نعرف عند استخدم انزيم معين .. كم مرة يقطع فى الجين ..

فاننى فى البداية يجب ان اعرف ععد القواعد التى تكون تسلسل موقع القطع Restriction site  ..
 وهذه القواعد تساوى عدد n من القواعد .. فاقوم بالتعويض عنها فى القانون  التالى ..

و ببساطة اقوم باستخدام هذا القانون
عدد القطع = ( 1/4 ) n

حيث ..:
و 4 تمثل عدد حروف اللغة الجينية وهى قواعد النتروجين الاربعة
و n تمثل عدد القواعد المعينة الخاصة بكل انزيم التى يتعرف عليها ويقطع عندها الجين .

ارجو ان تكون وصلت ..
العنوان: نقاش اليوم الثالث لدورة البيوانفورماتك
أرسل بواسطة: دانة العراقية في أكتوبر 09, 2005, 07:11:27 مساءاً
شكراااااااااااااااا على هذه الدوره الي تجنن:D
والله معلومات قيمه واعتقد هسه اني حسيت انو الاحياء علوم الحياه(البايولوجي)وليس الممات(الدايولوجي):D
مثل الي درسناها في العراق:D
العنوان: نقاش اليوم الثالث لدورة البيوانفورماتك
أرسل بواسطة: bioComputer في أكتوبر 09, 2005, 07:12:54 مساءاً
شكرا لك استاذى ابو سلطان على اجابتك الرائعة دوما وابدا ...:)

لذلك ساقوم بتعديل السؤال كالتالى :
" ما هو الانزيم المستخدم لاضافة  عناصر مشعة الى شريط الدنا ؟؟؟  "


سؤال اخر :
اكتب منطقة القطع الخاصة Recognition Sequence    للانزيمات الاتية مع ذكر  .. عدد قواعد هذا التتابع ؟؟

Eco R1 ، Bgl I ، Not I ، Bpm I

:)
العنوان: نقاش اليوم الثالث لدورة البيوانفورماتك
أرسل بواسطة: bioComputer في أكتوبر 09, 2005, 07:22:41 مساءاً
الاحت دانة .... الان فهمت ;)

اللهم انصر اخوننا المسلمين فى كل مكان وايديهم بمدد من عندك وثبتهم واهزم اعدائهم ...
العنوان: نقاش اليوم الثالث لدورة البيوانفورماتك
أرسل بواسطة: أبو سلطان في أكتوبر 09, 2005, 08:18:20 مساءاً
السلام عليكم ورحمة الله : تحية طيبة

اقتباس
" ما هو الانزيم المستخدم لاضافة  عناصر مشعة الى شريط الدنا ؟؟؟  "


انزيم اضافة الفوسفات Polynucleotidekinase

 يستخدم لاضافة فوسفات معلم بالاشعاع ( تم تعريضه للاشعاع ) للناقل على الطرف 5
الذى به مجو عة الهيدروكسيل للحصول على ناقل معلم ومميز بالاشعاع حتى يسهل فحصه
وتتبعه بعد ذلك ..

تحياتي ....
العنوان: نقاش اليوم الثالث لدورة البيوانفورماتك
أرسل بواسطة: أبو فيصل في أكتوبر 09, 2005, 11:12:01 مساءاً
السلام عليكم ,,


اقتباس
تمام استاذى ابوفيصل .... ولكنها من خارج نطاق الدرس .......هههههههههههههههه

امزح ...



عزيزي الحيوي أخبرني لماذا تمزح .... هذه الطريقة لإستخلاص الدنا أو
الرنا إشتغلت عليها شخصياً إضافةً أنني رأيتها في عدة أفلام علمية وبحثية بنفسي :angry:





 أمزح  :D



 الأخت دانة ,, لكِ لمسات علمية وأخرى فكاهية .. خاصةً الدايولوجي  :D



 بارك الله فيكم ونفع بكم ,, اللهم آمين .
العنوان: نقاش اليوم الثالث لدورة البيوانفورماتك
أرسل بواسطة: bioComputer في أكتوبر 10, 2005, 12:21:45 صباحاً
استاذى الغالى ابو فيصل ...... والله موضوع الهندسة الوراثية وعزل الاحماض شيق وممتع وايضا بحوره عميقة ..
والحقيقة انا اريد التركيز على نقاط رئيسية يستطيع اى فرد الانطلاق منها ذاتياً ليكمل المشوار ...
بدلا من كثرة المعلومات التى ربما تكون ضرارها اكثر من نفعها .. ;)

ولكن الحقيقة هذه هى فائدة النقاش انه يمكنك التوسع فى امور لم تدرجها فى الدرس من اجل اضافات معلومات جديدة .ز خصوصا اذا كان اهل الدورة متخصصين مثلكم .ز وايضاً ما شاء الله فى مستواك ...

ولكن الدورة موجهة اساسا الى طلاب الحاسب الالى الذين قد يكرهون حتى كلمة بيولوجى ..:angry:

ولكن اخبرنى اخى الكريم .. اين اشتغلت تلك الاختبارات .ز هل فى معمل الكلية ..؟؟
العنوان: نقاش اليوم الثالث لدورة البيوانفورماتك
أرسل بواسطة: Dawn Breeze في أكتوبر 10, 2005, 12:33:01 صباحاً
السلام عليكم ورحمة الله وبركاته

ما شاء الله تبارك الله..
ربي يبارك لكم في علمكم وينفع بكم الإسلام والمسلمين..
وتحية لأستاذنا bioComputer، ولكل المشاركين في هذه الدورة، التي أسأل الله أن ينفعنا وإياكم بها، وأن يجعلها في موازين حسنات جميع القائمين عليها..


وبالنسبة لإجابة الأخ المشرف أبو سلطان عن إضافة العناصر المشعة: رائعة جداً، وبالمختصر المفيد جداً..

:)
العنوان: نقاش اليوم الثالث لدورة البيوانفورماتك
أرسل بواسطة: bioComputer في أكتوبر 10, 2005, 12:51:37 صباحاً
رجاء مراحعة رابط تغيير الوعد للاهمية
http://olom.info/ib3/ikonboard.cgi?act=ST&f=48&t=21854

:)د
العنوان: نقاش اليوم الثالث لدورة البيوانفورماتك
أرسل بواسطة: أبو فيصل في أكتوبر 10, 2005, 05:43:56 صباحاً
مرحبتين ,,


 نعم ياعزيزي إشتغلت عليها بالجامعة ,, وكانت العملية بإختصار شديد :

 1. إكثار وتنشيط النمو لدى سلالة بكتيرية بهدف زيادة البلازميد .

 2. وضع مضاد حيوي بنبة بسيطة لإسمرار تضاعف البلازميد .

 3. تغير البيئة بإستمرار - مزرعة مستديمة أو مستمرة - مع التحضين عند نفس الظروف .

 4. قتل جميع الخلايا الموجودة بالمعلق بزيادة معدل المضاد لضعفين المعدل الأساسي .

 5. تسليط جهاز التفتيت الصوتي على المعلق بعد قياس كثافة الحمل البكتيري ,, وذلك لتكسير جدر الخلايا وخروج البلازميدات .

 6. إستبعاد العضيات الغير مرغوبة بالتدريج في الطرد المركزي .. حتى نصل إلى 80000 ثمانين الف لفة في الدقيقة ... عدة خطوات .

 7. حقن المستخلص في الجل ,, ثم وضع الجل في جهاز الفصل الكهربي .


 وبموجب إختلاف الشحنة وحجم الرنا الصغير مقارنة بحجم الدنا ستجد بإذن الله كلٍ على حدة واضحاً عند المشاهدة بجهاز الأشعة الفوق بنفسجية .


 جميع الخطوات عملها البروف وإحنا كطلاب تدربنا على الحقن في الجل فقط ,,

ومن أراد مشاهدة هذه العملية الجميلة لإستخلاص الدنا عن الرنا على فيلم علمي فقط يكتب /  plasmid Isolation في محرك بحث الأفلام ..  :)


 تحياتي للجميع .
العنوان: نقاش اليوم الثالث لدورة البيوانفورماتك
أرسل بواسطة: دانة العراقية في أكتوبر 10, 2005, 07:02:10 صباحاً
يعني شو الدوره بس لاهل الحاسوب الي يكرهون البايولوجي:angry:

اني احب البايو:(  اذا الدوره ليست لي:(

اروح ارجع على الدايو احسن

لا  لا  لا تتوسلون بعد ما ارجع زعلت

وراح اكره البايو وروح اغير اختصاصي :(

                     دانه
العنوان: نقاش اليوم الثالث لدورة البيوانفورماتك
أرسل بواسطة: bioComputer في أكتوبر 10, 2005, 07:33:25 صباحاً
ما شاء الله عليك اخى ابوفيصل .. ونحن كذلك فى الجامعة ..
ولكن حقيقة شباب الباحثين فى المركز القومى للبحوث فاموا معى بخير واجب فى هذا الموضوع ... ولا اخفى عليك سرا هم من ارشدونى الى مووع البيوانفواتك وقدموا كل جهودهم ومساعدتهم لعمل تلك الدورة ... وحقيقة هذه الدوة ليست الا شئ صغير جداااااااا من رد الجميل لاهله ...
العنوان: نقاش اليوم الثالث لدورة البيوانفورماتك
أرسل بواسطة: bioComputer في أكتوبر 10, 2005, 07:38:46 صباحاً
لا ... لالالالا ...
ليست انت المقصودة اختى الغالية dana_thecat..
الحقيقة انت مش باين عليك ان تخصصك حاسب خالص ...:p
باين عليك انك ..





من الناس النوسوعيين :)
العنوان: نقاش اليوم الثالث لدورة البيوانفورماتك
أرسل بواسطة: دانة العراقية في أكتوبر 10, 2005, 03:59:53 مساءاً
النوسوعيين ؟؟؟؟؟؟؟؟؟؟؟؟؟؟؟؟؟؟؟؟؟؟؟؟؟؟؟؟؟؟؟؟؟؟؟؟؟
:(