Advanced Search

المحرر موضوع: دورة البيوانفورماتك :: الدرس الثانى جـ 1  (زيارة 6238 مرات)

0 الأعضاء و 1 ضيف يشاهدون هذا الموضوع.

أكتوبر 05, 2005, 07:42:19 صباحاً
زيارة 6238 مرات

bioComputer

  • عضو متقدم

  • ****

  • 746
    مشاركة

  • عضو مجلس الحاسب

    • مشاهدة الملف الشخصي
    • www.c4arab.com
دورة البيوانفورماتك :: الدرس الثانى جـ 1
« في: أكتوبر 05, 2005, 07:42:19 صباحاً »


بسم الله الرحمن الرحيم




الدرس الثانى - الجزء الأول



الأحماض النووية





الاحماض النووية  :
من المركبات الأساسية التي تدخل في تكوين الكائن الحي حيث هى التى تكون الجينات.
سميت بالأحماض النووية لوجودها بكثرة في النواة. توجد في نواة الخلية ذات النواة الحقيقية (Eukaryotic cell). أو في سيتوبلازم الخلية ذات النواة الأولية (Prokaryotic cell) لانها لا يوجد بها نواة اصلاً .

والاحماض النووية عبارة عن نوعان  هما :
1- الدنا ( الـــ الدى ان اى  DNA )..
2- الرنا ( الـــ الدر ان اى  RNA ).. وهو ينقسم الى ثلاثة انواع ..



اولا : الدنا ( الـــ الدى ان اى  DNA )..                                      


الدنا مجموعة خيوط رفيعة الى درجة لايصدفها عقل !!!
وتوجد فى كل خلية بجسم الانسان .وهو الذى يكون الجينات التى تكون مرصوصة بعضها الى جوار البعض بطول هده الخيوط التى تحتوى على معلومات ووصفات معينة لصنع البروتينات التى تبنيها الخلية من أجل أن تعيش وتؤدى وظائفها .



اخذ اسم شريط الدنا  (الدى ان اى  DNA )  من الاحرف الاولى لــــ :
الحمض النووي المؤكسد باللغة الانجليزية
(دى اوكسى ريبو نيويليك اسيد DeoxyriboNucleic Acid ) .
و الاحماض النووية ( Nucleic Acid) مركبة من سلسلة متتابعة من  النيوكليدات(Nucleotides ) . حيث تعتبر النيوكلتيدات هى الوحدة البنائية للاحماض النووية .






وتتكون النيوكلتيدات من ثلاثة أنوع من المركبات:


1- فوسفات( Phosphate)
2- سكر( Sugar)  خماسي الكربون وهو سكر الرايبوز أو دي – أوكسي – رايبوز.
3- قاعدة نيتروجينية (Nitrogenous base ).تتبع البيورينات أو البيرميدينات..





الحمض النووي دي إن إي له تركيبة واحدة في الإنسان وفي كل الكائنات الحية.
 ويتكون شريط الدنا من سلسلتين متقابلتين تتلفان بعضهما جوار بعض على شكل سلم حلزونى .
وتتكون درجات هذا السلم من وحدات من السكر والفوسفات بالاضافة الى أربعة مركبات كيميائية عبارة عن مجموعة من القواعد النيتروجينية  تسمى بالنيوكليوتيدات nucleotides وهي: الأدنين أ (A) و الثيمين ث (T) و السيتوزين  س © و الجوانين  ج (G).


والتى تكون بمثاية الحروف الأربعة التى تكتب بها اللغة الوارثية على الدنا
فالجين  ما هو الا قطعةمن الدنا تحتوى على الاف من ترتيبات مختلفة من النيوكلتيدات على كرموسوم  واحد وهو يحتوى على جميع المعلومات الوارثية التى تحدد صفات الخلية والكائن الحى .





وتتكون كل درجة من سلم الدنا من اثنتين من النيوكلتيدات المترابطة بعضها ببعض فى صداقة أبدية عن طريق القواعد النتروجنية .
فنجد أن أ (A) خضراء اللون ترتبط دائما مع الصفراء اللون ث (T) و ث (T) ترتبط مع أ (A) دون غيرها
وكذلك ترتبط س ©  الزرقاء اللون مع ج (G) الحمراء اللون دائما دون غيرها ..ولم يحدث أبداً ان ارتبطت واحدة فى غير مكانها .





وهذا الارتباط بين قاعدتين يعرف بزوج من القواعد (Base Pairs). يحدد حجم الجينوم البشري بعدد أزواج  القواعد الموجودة في الخلية .ويعتقد أن خلايا الإنسان تحتوي على حوالي 3 بلايين زوج من القواعدbp  .

ويقاس شريط الدنا بوحدة (زوج القواعد Base Pairs) . اى عدد ازواج القواعد النتروجنية فى شريط الدنا
وعلى سبيل المثال الشريط الدى تراه فى الصورة امامك مكون من 22 زوج من القواعد (bp 22 ) ..
هل تحاول عدهم ..!!





فهذه النيوكليوتيدات تصطف جنبا الى جنب لتكون سلك طويل و مترابط و ذلك عن طريق رابطة فوسفاتية تربط السكر الذي قبلها بالسطر الذي  بعدها (و بالتحديد تربط الكربون رقم 5 في السكر الاول بالكربون رقم 3 في السكر الذي يليها).و هكذا ييستمر هذا الخيط الطويل من النيوكليوتيدات.
اما القواعد النتروجينية فهى ترتبط مع بعض عن طريق الروابط الهيدروجنية الضعيفة بواسطة ذارت الهيدروجين .



و الدنا هو عبارة عن خيطين من من تلك النيوكليوتيدات متلاصقين و مجدولين كما تجدل ضفيرة الشعر و ذلك بشكل محكم و دقيق و يحافظ على ذلك النظام الروابط التي بين هذه المركبات خاصة الروابط الفسفورية و الروابط التي بين االقواعد النيتروجينية.و لذلك فانه يطلق على الدنا سلسلة الدي ان اي(DNA CHAIN ) كما هو شائع بين المختصين.


وهذا ايضاً يعنى اذا شققنا السلم طولياً من المنتصف بحيث تنفصل كل سلسلة من النيوكليوتيدات عن الأخرى ثم نظرنا الى الى احدى السلسلتين وترتيب النيوكليوتيدات فاننا نستطيع ان نعرف ترتيب النيوكليوتيدات الأخرى على السلسلة الأخرى حتى ولم نراها...!!



وبهدا نحصل على سلمين من الدنا يحتوى كل منهما على نفس الترتيب من النيوكليوتيدات
وتحصل هده العملية أثناء أنقسام الخلية حيث يتم نسخ الدنا DNA الى أثنين حتى تحصل كل خلية جديدةعلى نسخى طبق الأصل من النسخة التى تحصل عليها الخلية الاخرى وهناك نسخ مفردة تخرج الى خارج الخلية فيها معلومات لتكوين البروتينات وهو ما يسمى بالرنا RNA  الدى سنتوجه اليه بالحديث الان .



ملحوظة :


تسلسل القواعد على شريط الدنا يشار اليه من الطرف خمسة 5 الى الطرف ثلاثة 3 دائما .



ويتم تسمية الشريط العلوى بواطوسون Watson والسفلى بكريك Crick تخليداً لدكرى العالمين .





أكتوبر 05, 2005, 08:04:27 صباحاً
رد #1

bioComputer

  • عضو متقدم

  • ****

  • 746
    مشاركة

  • عضو مجلس الحاسب

    • مشاهدة الملف الشخصي
    • www.c4arab.com
دورة البيوانفورماتك :: الدرس الثانى جـ 1
« رد #1 في: أكتوبر 05, 2005, 08:04:27 صباحاً »

ثانياً : الرنا ( الـــ الدر ان اى  RNA ).. وهو ينقسم الى ثلاثة انواع ..


1- RNAm الرنا الرسول (Messenger RNA )  .    
2- RNAr  الرنا الرايبوسومي (Ribosomal RNA)  .
3- RNAt  الرنا الناقل (Transfer RNA) .    

اخذ اسم الرنا (الدر ان اي RNA ) من الاحرف الاولى الحمض النووي باللغة الانجليزية(ريبو نيويليك اسيد RiboNucleic Acid ) .
وهى مثل الدنا DNA مركبة من سلسلة متتابعة من النيوكليدات(Nucleotides ).وكل نيوكليديت يتركب من ثلاث قطع:فوسفات( Phosphate) و سكر( Sugar) و قاعدة نيتروجينية (Nitrogenous base ).







الا انها تختلف عن الدنا فى ثلاثة فروق :


1- الرنا (الدر ان اي RNA ) خيط واحد مفرد والدنا عبارة عن شريط ثنائى مزدوج .
شريط الدنا DNA المزدوج :



شريط الرنا RNA المـــفرد :

- A-T G C A-T-C-G-A-T-C-G-C-G-C-T-A-T-G-C-A -





2- هو ان الدنا DNA تفتقر فيه ذرة الكربون رقم 2 إلى أوكسجين.. ولذلك يسمى بمنزوع الأكسجين Deoxy-ribose حيث أن مقطع ديوكسي تعني نزع الأكسجين ، بينما الرنا (الدر ان اي RNA ) كاملة وتسمى سكر الريبوز ribose.






3- القواعد النيتروجينية :
فى شريط الرنا يتم استبدال قاعدة الثايمين (T )  باليوراسيل(  U).
فبدلاً ان يكون الارتباط بين الأدينين (A) والثايمين (T )  فى الدنا يكون فى شريط  الرنا الارتباط بين الأدينين (A) واليوراسيل (  U)  .



جدول يوضح أهم الفروق بين DNA  و  RNA:





شكل يوضح الفرق بين الحمض النووي DNA و RNA



أكتوبر 05, 2005, 08:08:16 صباحاً
رد #2

bioComputer

  • عضو متقدم

  • ****

  • 746
    مشاركة

  • عضو مجلس الحاسب

    • مشاهدة الملف الشخصي
    • www.c4arab.com
دورة البيوانفورماتك :: الدرس الثانى جـ 1
« رد #2 في: أكتوبر 05, 2005, 08:08:16 صباحاً »
ملحوظة :
1- بعض الفيروسات التي يمثل ( DNA ) فيها المادة الوراثية ويوجد بها ( DNA) على هيئة خيط واحد فقط من متعدد النيوكليوتيدات.
2- بعض الفيروسات التي يمثل (RNA) فيها المادة الوراثية ويوجد بها (RNA) على هيئة خيطين من متعدد النيوكليوتيدات تتشابك مع بعضها البعض على هيئة حلزون ثنائي.




 ملحوظة هامة :
و تقسم القواعد النيتروجينية ايضا الى نوعين اساسيين من الناحية الكيمائية :
1-قواعد بيورينية Pruines : و هي اكبر حجما من النوع الثاني  وتنتج من التحام حلقة إيميدازول الخماسية مع حلقة البيرميدين وأهم هذه القواعد هى الأدينين Adenine و الجوانين Guanine

2-  قواعد بيرميدينية Pyrimidine: وهذه القواعد مشتقة من البيرميدين بإستبدال ذرات الهيدروجين الموجودة على كربون رقم 2،4،5  بمجاميع أمينو أوهيدروكسيل أو ميثايل وهم و هم سيتوزين Cytosine و اليوراسيل Uracil و الثايمين Thymine







أكتوبر 05, 2005, 08:29:18 صباحاً
رد #3

ابو يوسف

  • عضو خبير

  • *****

  • 10867
    مشاركة

  • مشرف اداري

    • مشاهدة الملف الشخصي
دورة البيوانفورماتك :: الدرس الثانى جـ 1
« رد #3 في: أكتوبر 05, 2005, 08:29:18 صباحاً »
السلام عليكم

مرفق طيه ملف pdf يشمل الجزء الاول من المحاضرة الثانية