Advanced Search

المحرر موضوع: نقاش اليوم الرابع لدورة البيوانفورماتك  (زيارة 3003 مرات)

0 الأعضاء و 1 ضيف يشاهدون هذا الموضوع.

أكتوبر 10, 2005, 08:25:40 صباحاً
زيارة 3003 مرات

bioComputer

  • عضو متقدم

  • ****

  • 746
    مشاركة

  • عضو مجلس الحاسب

    • مشاهدة الملف الشخصي
    • www.c4arab.com
نقاش اليوم الرابع لدورة البيوانفورماتك
« في: أكتوبر 10, 2005, 08:25:40 صباحاً »
السلام عليكم ورحمة الله وبركاته ...  
مرحباً بكم فى اليوم الثانى من  دورة مبادئ علم المعلومات الحيوية .... Bioinformatics ..

أذكركم بمراجعة دروس اليوم الرابع للاهمية ..


دورة البيوانفورماتك :: الدرس الرابع - جـ1


دورة البيوانفورماتك :: الدرس الرابع - جـ2

'<img'>

أكتوبر 10, 2005, 08:28:34 صباحاً
رد #1

bioComputer

  • عضو متقدم

  • ****

  • 746
    مشاركة

  • عضو مجلس الحاسب

    • مشاهدة الملف الشخصي
    • www.c4arab.com
نقاش اليوم الرابع لدورة البيوانفورماتك
« رد #1 في: أكتوبر 10, 2005, 08:28:34 صباحاً »
اكر اعتذراى عن عدم حصورى  نقاش اليوم فى الموعد .. على امل ان تم المناقشة بينكم جمعياً هنا .. وسأطلع عليها باذن اللله فى وقت اخر .. وشكرا لكم .

أكتوبر 11, 2005, 10:46:36 صباحاً
رد #2

bioComputer

  • عضو متقدم

  • ****

  • 746
    مشاركة

  • عضو مجلس الحاسب

    • مشاهدة الملف الشخصي
    • www.c4arab.com
نقاش اليوم الرابع لدورة البيوانفورماتك
« رد #2 في: أكتوبر 11, 2005, 10:46:36 صباحاً »
'<img'>

نعم النقاش ':angry:'

أكتوبر 11, 2005, 11:08:42 صباحاً
رد #3

bioComputer

  • عضو متقدم

  • ****

  • 746
    مشاركة

  • عضو مجلس الحاسب

    • مشاهدة الملف الشخصي
    • www.c4arab.com
نقاش اليوم الرابع لدورة البيوانفورماتك
« رد #3 في: أكتوبر 11, 2005, 11:08:42 صباحاً »
اسئلة للنقاش



1- كيف ينتقل البلازميد من خلية لاخرى ؟

2- لماذا غالباً استخدم انزيم واحد فى قطع كلا من البلازميد والجين ؟

3- ما الفرق بين النهايات غير لاصقة او النهايات التامة blunt  ؟

4- كيف ازيد الارتباط بين البلازميد مع الجين ؟

'<img'>




أكتوبر 11, 2005, 11:26:38 صباحاً
رد #4

bioComputer

  • عضو متقدم

  • ****

  • 746
    مشاركة

  • عضو مجلس الحاسب

    • مشاهدة الملف الشخصي
    • www.c4arab.com

أكتوبر 11, 2005, 11:42:39 صباحاً
رد #5

bioComputer

  • عضو متقدم

  • ****

  • 746
    مشاركة

  • عضو مجلس الحاسب

    • مشاهدة الملف الشخصي
    • www.c4arab.com
نقاش اليوم الرابع لدورة البيوانفورماتك
« رد #5 في: أكتوبر 11, 2005, 11:42:39 صباحاً »
فلاش عن تكوين Complementary DNA

http://www.vet.ed.ac.uk/clive/cal/DNA_1/Images/anim_4.swf



فلاش هاااااااااااااااااااااااام جدا

http://www.wiley.com/legacy....ing.swf


أكتوبر 11, 2005, 11:50:09 صباحاً
رد #6

bioComputer

  • عضو متقدم

  • ****

  • 746
    مشاركة

  • عضو مجلس الحاسب

    • مشاهدة الملف الشخصي
    • www.c4arab.com
نقاش اليوم الرابع لدورة البيوانفورماتك
« رد #6 في: أكتوبر 11, 2005, 11:50:09 صباحاً »
5- ما هى المكتبة الجينية او  المكتبات الوراثية ،، وما فائدتها ؟؟

6-   فيما يستخدم البى سى ار pcr ؟؟

'<img'>

أكتوبر 11, 2005, 01:29:40 مساءاً
رد #7

دانة العراقية

  • عضو خبير

  • *****

  • 1992
    مشاركة

    • مشاهدة الملف الشخصي
نقاش اليوم الرابع لدورة البيوانفورماتك
« رد #7 في: أكتوبر 11, 2005, 01:29:40 مساءاً »
1.فيما يستخدم البى سى ار pcr ؟

الجواب يستخدم في تكوين الدنا بطريق صناعيه
 
2. ما هى المكتبة الجينية او  المكتبات الوراثية ،، وما فائدتها ؟

الجواب هي عباره عن مجموعه من المستعمرات البكتيريه وكل مستعمره منها تحتوي على جين معين من جينوم الكائن
فائدتها  '<img'>


      


 '<img'>   دانه
ادرس القانون لاعرف الخيوط التي تحاك منها اكفان الحق والعدل  ':200:'

أكتوبر 11, 2005, 01:46:26 مساءاً
رد #8

دانة العراقية

  • عضو خبير

  • *****

  • 1992
    مشاركة

    • مشاهدة الملف الشخصي
نقاش اليوم الرابع لدورة البيوانفورماتك
« رد #8 في: أكتوبر 11, 2005, 01:46:26 مساءاً »
لماذا غالباً استخدم انزيم واحد فى قطع كلا من البلازميد والجين ؟

 الجواب لكي يتم   التتابع  بشكل واحد في كل من   البلازميد والجين

- كيف ازيد الارتباط بين البلازميد مع الجين

الجواب هناك طريقتان الاولى اضافه الوصلات الى الجين من الطرفين
                   الثانيه هي اضافه ذيل من سلسله القواهد المتشابهه في نهايه الجين

                  الدايولوجيست دانه'<img'>
ادرس القانون لاعرف الخيوط التي تحاك منها اكفان الحق والعدل  ':200:'

أكتوبر 11, 2005, 04:57:45 مساءاً
رد #9

دمية الثلج

  • عضو مساعد

  • **

  • 249
    مشاركة

  • عضو مجلس الاحياء

    • مشاهدة الملف الشخصي
نقاش اليوم الرابع لدورة البيوانفورماتك
« رد #9 في: أكتوبر 11, 2005, 04:57:45 مساءاً »
1- كيف ينتقل البلازميد من خلية لاخرى ؟
البلازميد هو شريط دائري بكتيري من الدنا يتم نقله للخلية المرادة بواسطة انزيم Eco RI بعد ان يتم قطعه و كذلك الحمض دنا في الخلية عن مكان معين بنهايات لاصقة .

2- لماذا غالباً استخدم انزيم واحد فى قطع كلا من البلازميد والجين ؟
حتى يكون التتابع واحد في البلازميد و في الحمض ويمكن استرجاع الجين مرة اخرى.

3- ما الفرق بين النهايات غير لاصقة او النهايات التامة blunt  الى نهايات تامة ؟
النهايات غير اللاصقة التي تم قطعها بإنزيم في البلازميد مختلف عن انزيم قطع الحمض DNA فلا ينتج نفس التتابع لكلا من البلازميد و الجين وبالتالي لا يمكن استرجاع الجين بعد الارتباط

اما النهايات التامة فيكون القطع في الحمض و البلازميد بنفس الإنزيم مما يعطي نفس التتابع ويمكن استرجاع الجين بعد الارتباط بنفس الانزيم .

4- كيف ازيد الارتباط بين البلازميد مع الجين ؟
يتم الارتباط بين الجين و البلازميد بروابط هيدروجينية ضعيفة لكن يتم زيادة الارتباط بواسطة انزيم يسمى اللاصق(Ligase ) .

**********************************************
لي هنا سؤال أستاذي  ( ذكرت انه القطع بنفس الانزيم يعطي نهايات لاصقة فهل الربط بهذا لانزيم اللاصق(Ligase ) يؤدي الى عدم امكانية استرجاع الجين مرة اخرى ؟؟؟؟؟؟؟؟
**********************************************

5- ما هى المكتبة الجينية او  المكتبات الوراثية ،، وما فائدتها ؟؟
المكتبة الجينية عبارة عن توليفة او تجميعة من مستعمرات بكترتية تحتوى كل مستعمرة منها على جين معين من الجينوم الكلى للكائن نظريا ً .
المكتبة الجينية بمثابة مكتبة نحصل على اي جين منها طبعا الكلام بشكل نظري اي تتوافر فيها معلومات عن كل جين بالتفصيل .

6-   فيما يستخدم البى سى ار pcr ؟؟
وهى تقنية حديثة فى مجال الهندسة الوارثية وتقوم فكرة عملها تكوين الدنا بطريقة صناعية ..
وانا هنا ابي أعرف المقصود بصناعية هل توفير قطع من الحمض النووي في صورة مماثلة ( لبنك الدم ) يعني من أجسام الكائنات .


هنا عندي لبس في استيعاب المعلومة
وبالتالى يتم ربط او لحم  الجين مع البلازميد عن طريق لصق قطعة الدي إن أي في داخل الفراغ الناتج من القطع فى البلازميد ينتج لنا قطعة مركبة من قطعتين مختلفتين من الدي إن أي

ما ادري ليش قطعتين و الربط كان مع بلازميد في قطعة واحدة من الدنا ..انا فهمت من الكلام ان راح اكون قطعتين وانا في الاصل فصلت قطعة واحدة ؟؟؟؟

أكتوبر 11, 2005, 05:11:44 مساءاً
رد #10

Dawn Breeze

  • عضو مبتدى

  • *

  • 60
    مشاركة

    • مشاهدة الملف الشخصي
نقاش اليوم الرابع لدورة البيوانفورماتك
« رد #10 في: أكتوبر 11, 2005, 05:11:44 مساءاً »
السلام عليكم ورحمة الله وبركاته

أعتذر عن عدم حضوري بالأمس'<img'> ..
والسبب كان: الدراسة!
فنلتمس المعذرة!!


محاولتي لإجابة أسئلة النقاش كالتالي:


اقتباس
1- كيف ينتقل البلازميد من خلية لاخرى ؟

ينتقل بفعل الانقسامات من الخلية (التي يتواجد فيها)، إلى الخلايا الناتجة عن هذه الانقسامات..


اقتباس
2- لماذا غالباً استخدم انزيم واحد فى قطع كلا من البلازميد والجين ؟

ليكون لدينا التتابع نفسه في كل من البلازميد والجين


اقتباس
3- ما الفرق بين النهايات غير لاصقة او النهايات التامة blunt  الى نهايات تامة ؟

النهايات التامة/الغير لاصقة: تكون قابليتها للالتحام بين البلازميد والجين ضئيلة
النهايات اللاصقة/ الغير تامة:تكون القابلية لالتحام البلازميد بالجين أقوى


اقتباس
4- كيف ازيد الارتباط بين البلازميد مع الجين ؟

يمكن زيادة الارتباط بينهما بإحدى الطريقتين:
1-  باستخدام الوصلات Linker
2-  اضافة ذيل من سلسلة القواعد المتشابهة  Homopolymer tail


اقتباس
5- ما هى المكتبة الجينية او  المكتبات الوراثية ،، وما فائدتها ؟؟

عبارة عن توليفة او تجميعة من مستعمرات بكترتية تحتوى كل مستعمرة منها على جين معين من الجينوم الكلي للكائن.
وفائدتها أنها تعتبر من مصادر الدنا


اقتباس
6- فيما يستخدم البى سى ار pcr ؟؟

تكوين الدنا بطريقة صناعية

أكتوبر 11, 2005, 05:17:07 مساءاً
رد #11

Dawn Breeze

  • عضو مبتدى

  • *

  • 60
    مشاركة

    • مشاهدة الملف الشخصي
نقاش اليوم الرابع لدورة البيوانفورماتك
« رد #11 في: أكتوبر 11, 2005, 05:17:07 مساءاً »
طيب عندي تقريبا نفس تساؤلات أختي دمية الثلج ، فصار عندي التباس في عمليات إدخال الجين للبلازميد، ففي أي من العمليات نستطيع استرجاع الجين، وفي أي منها لا نستطيع استرجاعه؟؟

أكتوبر 12, 2005, 01:11:56 صباحاً
رد #12

bioComputer

  • عضو متقدم

  • ****

  • 746
    مشاركة

  • عضو مجلس الحاسب

    • مشاهدة الملف الشخصي
    • www.c4arab.com
نقاش اليوم الرابع لدورة البيوانفورماتك
« رد #12 في: أكتوبر 12, 2005, 01:11:56 صباحاً »
السلام عليكم ..
كيف حالكم ... لازم تشوفوا العين الحمر علشان تتشغلوا .... طيب النهاردة
مفيش مراوح ':p'




رد حول الالتباس :
اقتباس

وبالتالى يتم ربط او لحم  الجين مع البلازميد عن طريق لصق قطعة الدي إن أي في داخل الفراغ الناتج من القطع فى البلازميد ينتج لنا قطعة مركبة من قطعتين مختلفتين من الدي إن أي و هذه القطعة تسمى دي إن أي مهجّن أو (Recombinant DNA ). كما  هو واضح بالشكل .

ويلاحظ طيعاً انه يمكن استعادة نفس الجين مرة اخرى عن طريق استخدام نفس  الانزيم مرة اخرى .. حيث انه لم يحدث اى تغير تتابع و تسلسل الدنا وظل مكان القطع كما هو ( GAATTC).



اقتباس

ما ادري ليش قطعتين و الربط كان مع بلازميد في قطعة واحدة من الدنا ..انا فهمت من الكلام ان راح اكون قطعتين وانا في الاصل فصلت قطعة واحدة ؟؟؟؟

كلامك صحيح ... قطعتين عائدة على اللازميد ...ز اى ان البلازميد اصبح يحتوى على قطتعين .. واحدة من الجين والثانية هى بقية البلازميد

أكتوبر 12, 2005, 01:18:00 صباحاً
رد #13

bioComputer

  • عضو متقدم

  • ****

  • 746
    مشاركة

  • عضو مجلس الحاسب

    • مشاهدة الملف الشخصي
    • www.c4arab.com
نقاش اليوم الرابع لدورة البيوانفورماتك
« رد #13 في: أكتوبر 12, 2005, 01:18:00 صباحاً »
مش عارف .. حاسس ان الدرس كان ثقيللا والناس مش فهماه ....:(

ياريت كلكطوا شفتوا الفلاشات ...؟؟؟

من لديه اى اسئل فلا يتردج فى طرحها .. حتى انتهى من تويح بعض الاشياء ..

أكتوبر 12, 2005, 01:21:30 صباحاً
رد #14

ابو يوسف

  • عضو خبير

  • *****

  • 10867
    مشاركة

  • مشرف اداري

    • مشاهدة الملف الشخصي
نقاش اليوم الرابع لدورة البيوانفورماتك
« رد #14 في: أكتوبر 12, 2005, 01:21:30 صباحاً »
اقتباس (bioComputer @ 11/10/2005 الساعة 23:18)
مش عارف .. حاسس ان الدرس كان ثقيللا والناس مش فهماه ....:(

ياريت كلكطوا شفتوا الفلاشات ...؟؟؟

من لديه اى اسئل فلا يتردج فى طرحها .. حتى انتهى من تويح بعض الاشياء ..

بصراحة حتى الان لم اقرأ الدرس  ':blush:'

هذه الايام هنالك تصحيح اختبارات ومشاغل في المدرسة

اخوك
ابو يوسف - التلميذ الكسول